DNA med strenge og baser
DNA molekylerne er sammenpakket ved hjælp af proteiner, når de ligger i cellekernen som kromosomer.
Så fylder de mindst muligt.
Samtidig er de godt beskyttet.
Når man skal lære om DNA´s opbygning, er det smart at bruge “stigemodellen”.
Vi “vrider” nærmest 3D dobbelt helix ud i en 2D form.
DNA molekylet består af 2 strenge med baser i mellem.
Nu ligner det en stige.
Det er en hydrogenbinding mellem to baser overfor hinanden, der holder strengene sammen.
Baserne ses som stigens trappetrin.
Baserne uddybes her.
DNA tripletter
Baserne sidder 3 sammen på hver streng.
De danner en triplet = en DNA codon:
Baserne med tripletter er her adskilte, så der ses 2 strenge, hvor baserne ikke er bundet sammen.
Basernes binding brydes i forbindelse med replikation, transkription og evt. reparation/vedligeholdelse.
Baserne er bundet til DNA strengens deoxyribose-molekyle.
DNA strengene
Mellem DNA strengene har vi altså baserne.
Baserne er bundet til DNA strengens deoxyribose-molekyle.
Basernes bindinger er ikke vist på disse tegninger.
Selve DNA strengene er opbygget af to forskellige slags molekyler: phosphatgrupper (lilla) og deoxyribose (rød), som det fremgår af tegningen herunder.
Strengene er ens og alligevel forskellige
Selv om strengene består af de samme molekyler, så er der forskel på dem.
De er hinandens “omvendte”.
5´- strengen og 3´- strengen
Den ene streng har sit deoxyribose-molekyle vendt, så carbonatom nr. 5 har bindingen (gul streg) til phosphatgruppen over sig.
Strengen kaldes 5´ – 3´ strengen (fem mærke til tre mærke strengen).
Den anden streng har sit deoxyribose-molekyle vendt den anden vej, så carbonatom nr. 3 har bindingen (gul streg) til phosphatgruppen over sig.
Strengen kaldes 3´ – 5´ strengen (tre mærke til fem mærke strengen).
Tegningen viser, at hvis 5´- strengen drejes 180 grader, så vender den som 3´- mærke strengen.
Strengene er hinandens omvendte:
den ene streng vender 5´- 3´
den anden streng vender 3´-5´
MEGET VIGTIG LÆRING:
For at forstå hvordan tripletterne = codons aflæses på en DNA streng er der én vigtig hovedregel!
For at lære om replikation og transkription er det nødvendigt at huske 3 simple regler.
Det er ikke nødvendigt at forstå disse regler, men forhåbentligt har tegningerne ovenfor hjulpet læringen godt på vej.
Ellers får vi designet nogle bedre illustrationer!
HOVEDREGLEN
Basernes rækkefølge i en triplet = codon læses altid i rækkefølgen 5´-3´.
HUSK PÅ DET!
REGEL NR. 1
Når DNA molekylets strenge skal forlænges med nye baser, skal de ALTID tilføres i 5´- 3´ retningen (bemærk: i læseretningen).
REPLIKATION
REGEL NR. 2 A
Regel nr. 1 betyder, at når 5´- 3´ strengen skal kopieres under replikationen, så vil dens nye 3´- 5´streng blive fremstillet i den helt rigtige retning:
Den nye strengs baser sættes nemlig på i 5´- 3´retningen (nedefra på tegningen).
REGEL NR. 2B
Når 3´- 5´strengen skal kopieres, kræves helt specielle tiltag (Okazaki-fragmenter) for at danne den nye 5´- 3´ streng.
Se proceduren under replikation.
TRANSKRIPTION
REGEL NR. 3
Dannelsen af en m-RNA streng under transkriptionen sker altid ud fra 3´- 5´ DNA strengen.
Derfor er det altid i “den rigtige retning” m-RNA baserne sættes på:
m-RNA baserne sættes nemlig på en 3´-5´m-RNA streng “nedefra”.
Derfor ankommer de helt korrekt til 5´-enden først.
Derfor er det unødvendigt med de specielle tiltag (Okazaki-fragmenter), når m-RNA strengen skal dannes.
